湄洲妈祖祖庙，俗称祖庙，主祀天后妈祖，位于湄洲岛北部宫下村，始建于公元987年。

妈祖其人，姓林名默，又称默娘。宋太祖建隆元年（公元960年）农历三月廿三诞生在今福建莆田湄洲岛东蔡村石后上林自然村。她一生乐于助人，精研医理，熟悉水文气象，以博爱为怀，扶危济困、救苦救难。宋雍熙四年（公元987年）农历九月初九，妈祖因救助海难而逝，乡亲感念其恩德，就在家乡最高处“湄峰”为其建庙奉祀，据史料记载为“仅落落数椽”的“通贤神女”庙。这是世界上第一座妈祖庙，因而被尊称为“祖庙”。

因妈祖圣迹昭彰，信众越来越多，妈祖信仰从民间传到官府朝廷，获得士农工商各界认可，无远弗届。祖庙先经商人三宝等妈祖信众不断“鸠资扩建”，到宋天圣年间（公元1023—1032年）， “廊庑益增巍峨”，已初具规模。元朝，祖庙进一步扩建，庙宇“面势轩豁”，“殿阁肆兀”。明朝，妈祖祖庙又更加扩展。洪武七年（公元1274年），泉州卫指挥周坐主持重建寝殿、香亭、鼓楼、山门。永乐初年（公元1403年），郑和下西洋时，因得益妈祖庇佑，遂奉旨遣官整修祠庙。宣德六年（公元1431年），郑和最后一次下西洋之前，亲自与地方官员备办木石，再次修整祖庙；俾之“湄洲清景胜蓬莱”。

清代，康熙二十二年（公元1683年），福建总督姚启圣重建钟鼓楼和山门；1684年，靖海侯施琅增建梳妆楼、朝天阁、佛殿、僧房。接着祖庙又建观音殿、中军殿、土地庙等。到清乾隆以后，湄洲妈祖祖庙已颇具规模，成为有16座殿堂楼阁、99间客舍斋房，整个建筑群依山而筑，雕梁画栋，嵯峨壮观，被人称为“海上龙宫”。

今天展现在我们面前的妈祖祖庙建筑群是二十世纪八十年代起，按照“依旧修旧”的原则，海峡两岸妈祖信众同心协力，捐物捐资重建的。至1994年，祖庙西轴线全部建成。1998年南轴线开工，至2002年建成。如今，湄洲妈祖祖庙以前所未有的雄伟身姿，又屹立于海峡之滨，不但重显光彩，而且更加富丽堂皇。